Folding@home - поможем ученым исследовать тяжелые заболевания

Закрыто
Игорь
Главный модератор
Главный модератор
Сообщения: 22063
Зарегистрирован: 03 окт 2013, 20:29
Контактная информация:

Folding@home - поможем ученым исследовать тяжелые заболевания

Сообщение Игорь »

Folding@home2.JPG
Проект был запущен 1 октября 2000 года. И через некоторое время уже тысячи компьютеров пользователей делились своей простаивающей вычислительной мощностью с Folding@home.

2005 - запущен проект по антибиотикам, начали исследование болезни Альцгеймера, "хрустального" человека, рака, Паркинсона.
2006 - старт исследования болезни Гентингтона
2007 - ноябрь 2012 - в проекте Folding@home смогли принять участие владельцы PS3.
2008 - исследование вирусных заболеваний, результаты по болезни Альцгеймера
2010 - запущено исследование болезни Шагаса, малярии
2011 - начало исследования диабета

К 2013 году мощность всех объединенных компьютеров составляла 10 петафлопс.
В 2014 мощность возросла до 40 петафлопс
19 июля 2016 года была преодолена отметка вычислительной мощности в 100 петафлопс. Для сравнения, самый мощный суперкомпьютер в мире обеспечивает 93 петафлопса (в пике - 125). Суперкомпьютер создан в Китае в 2016 году (Sunway TaihuLight)

Как это работает?
Скачиваем клиент или подключаемся в браузере. Регистрируемся, можно сразу примкнуть к команде, чтобы с первой минуты приносить очки команде. Далее нашему устройству присылают рабочие пакеты, которые он обрабатывает и посылает обратно. Соответственно, должно быть подключение к интернет(пусть и не постоянное).
Есть два режима работы - одновременно с работой компьютера и в фоне.
Сам режим в трех вариантах - слабый, средний и максимальный. В принципе, среднего более чем достаточно. Загрузка на максимум особого прироста в производительности не дает.
Folding@home.JPG
Загрузка клиента для ПК:
http://folding.stanford.edu/start-folding/
Загрузка клиента для андроид (Dainius34):
https://play.google.com/store/apps/details?id=com.sonymobile.androidapp.gridcomputing
В случае с мобильниками, устройство должно быть заряжено на 100% и подключено к зарядке. Рекомендуют оставлять на ночь для работы.

Присоединиться к исследованиям:
- любым
- Альцгеймера
- рака
- Гентингтона
- Паркинсона

Официальный сайт - http://folding.stanford.edu/

Команды, номера для присоединения:
Беларусь:

Folding Belarus (FBY) - 11897
Minsk Team - 48709

Казахстан:

KazakhstanTeam - 163012
Folding.kz - 229215

Россия:

TSC! Russia - 47191
Russia - 279
Transhumans - 43003

Украина:

Ukraine - 2164
overclockers.ua - 156571
Подробнее - Folding@home

По мощности видеокарты имеют гораздо больший вес относительно любых процессоров.
видеокарты.JPG
Участников почти 2 млн, но их львиная доля, что называется, зашли посмотреть:
ранг.JPG
За несколько часов с 1 876 780 поднялся до 691 346.
На текущий момент кол-во участников:
сейчас.JPG
Помогли подобрать телевизор? Оставьте свой отзыв о покупке:)
Раздел для отзывов
Подобрали модель телевизора? Сравните цены в магазинах перед покупкой Изображение
Игорь
Главный модератор
Главный модератор
Сообщения: 22063
Зарегистрирован: 03 окт 2013, 20:29
Контактная информация:

Re: Folding@home - поможем ученым исследовать тяжелые заболевания

Сообщение Игорь »

Обычно на выполнение задания дается 6-9 дней, при этом современный компьютер может выполнить эту задачу за 4-6 часов. Т. Е., вполне реально за пару вечеров сдавать задания.
Процессор и видеокарта выполняют разные задания, поэтому очки будут суммироваться в итоге.
Помогли подобрать телевизор? Оставьте свой отзыв о покупке:)
Раздел для отзывов
Подобрали модель телевизора? Сравните цены в магазинах перед покупкой Изображение
Игорь
Главный модератор
Главный модератор
Сообщения: 22063
Зарегистрирован: 03 окт 2013, 20:29
Контактная информация:

Re: Folding@home - поможем ученым исследовать тяжелые заболевания

Сообщение Игорь »

Задание обычно имеет свой номер, в котором подробно указано о проекте.

Например, проц за сутки выполняет задание Project 8695:
123.jpg
"Disease Type: Cancer
Protein-protein interactions (PPIs) have attracted considerable attention as targets for disruptive inhibitors.  Such molecules can be used to probe cellular processes, or act as therapeutic drugs.  Targeting these interfaces with small drug-like molecules has been challenging to the large interaction surfaces involved, driving interest toward a new class of larger molecules designed to mimic peptides and proteins--peptidomimetics.
Cyclic peptides have showed great promise as potential peptidomimetic drugs (1, 2). A recent experimental NMR study of four cyclic beta-hairpins designed to mimic the p53 TAD alpha helix and competitively inhibit its binding partner, MDM2, suggests that ligand flexibility is an important determinant of affinity (3).  
This work has inspired us to use molecular dynamics simulation to understand the binding these designed ligands with MDM2.  We hope the thermodynamic and kinetic information obtained from our simulations will help us understand the molecular mechanism of binding in atomic detail, and give insight into how to leverage the role of ligand flexibility in future drug discovery efforts."

Видеокарте остался час работы над Project 11407:
1234.png
1234.png (62.89 КБ) 1237 просмотров
"Disease Type: Cancer
Projects 11400 and 11401 examine Abl1 and Src kinases.
Abl kinase has a special place in the history of cancer therapeutics, ‘dispelling the long-held myth that it was not feasible to develop selective inhibitors of key cell-signaling molecules as safe and effective medicines.’ Novartis’ development of the drug imatinib (or Gleevec commercially) to treat chronic myelogenous leukemia (CML) specifically targets a mutant Abl kinase that results from a chromosomal abnormality called ‘the Philadelphia chromosome’. There is even a book out recently that chronicles the development of Gleevec (The Philadelphia Chromosome). 
While the success of imatinib was remarkable, many patients develop resistance to it and regress. A more recent drug targeting Abl kinase, ponatinib of Ariad Pharmaceuticals (Iclusig commercially), has been developed that overcomes some of these resistance mutations. However, now even ponatinib has been found to be susceptible to resistance mutants. With these simulations of Abl kinase, we are hoping to begin to understand a structural basis for the development of resistance mutants so we can develop drugs that anticipate and overcome them before the patient even has to experience regression. But to do this we will need many long timescale trajectories of Abl and later its mutants to achieve this deeper understanding of the development of resistance in CML. Additionally, this knowledge could inform models of resistance development in other cancers that result from kinase mutations or kinase up-regulation.
The Src gene was first discovered as responsible for the tumorogenicity of Rous sarcoma virus. This gene is also present in animals, and it is in fact a mutated Src gene that is injected back into the host that causes cancer, not a viral gene. The discovery that cancer was a result of mutated naturally occuring genes and not viral ones was a milestone in cancer research and Harold E. Varmus and J. Michael Bishop were awarded the Nobel Prize in Physiology or Medicine for this and related discoveries of the cellular origin of retroviral oncogenes in 1989.
Since then Src has been found to be over-expressed and/or highly activated in a variety of cancers, most notably linked to metastasis in breast, prostate, and colon cancers. The drug dasatinib of Bristol-Myers Squibb (Sprycel commercially), has been approved for treatment of CML (described more fully in our blog post on Abl kinase), but it was also recently in clinical trials for metastatic prostate cancer due to its affinity for Src kinase.

This project is managed by Dr. Sonya Hanson at Memorial Sloan Kettering Cancer Center.
http://www.choderalab.org/members/#sonya-hanson
Sonya Hanson is a postdoctoral fellow at the Memorial Sloan Kettering Cancer Center studying the origin of selectivity of target small molecule kinase inhibitors for the treatment of various cancers."
Помогли подобрать телевизор? Оставьте свой отзыв о покупке:)
Раздел для отзывов
Подобрали модель телевизора? Сравните цены в магазинах перед покупкой Изображение
Закрыто

Вернуться в «Это интересно»